小琉球民宿一般采用自然通風、機械通風以及空調系統(空調設備裏的過濾器要定期清洗，保證室內空氣新鮮，進風口一定要在室外)。小琉球住宿內的各種垃圾、廢棄物必須做到即時清運，日産日清。小琉球住宿的垃圾應由專人集中收集，作爲城市垃圾的一部分，由城市垃圾管理部門統一運輸處理，較大的民宿和遠離市區的民宿應有獨立的垃圾處理系統，一般以焚燒處理爲宜，做到日産日清。
一般的小琉球民宿用水由城市自來水管網供給。自備水源的選擇和水質應完全符合我國生活飲用水的衛生標准，小琉球民宿必須設有備用貯水池，貯水容量至少可供使用24小時，貯水池的建築材料和防水措施〔水的加壓和提升供水及管網配置)均應符合生活飲用水衛生標准:小琉球住宿的排水設施必須通暢，保證環境整潔。